Protistu sistemātiku veido jebkuri eikariotu organismi (organismi ar kodolu saturošām šūnām), kas nav dzīvnieki, augi vai sēnes. Protisti neveido dabisku grupu vai kladu, jo tie izslēdz dažus eikariotus, ar kuriem tiem ir kopīgs sencis, bet, tāpat, kā aļģes vai bezmugurkaulnieki, šī grupa tiek izmantota ērtībai. Dažās bioloģiskās klasifikācijas sistēmās, kā piemēram Roberta Vittekera 1969. gadā piedāvātā piecu valstu shēma, valsti ar nosaukumu "Protista" sastāda vienšūnu organismi vai koloniālie vienšūnu organismi, kuri neveido audus.[1] Ir grupas, kuras satur protistus kopā ar citiem organismiem. Klada Opisthokonta kopā ar protistiem ietver arī dzīvniekus un sēnes, bet Archaeplastida valsts vēl satur arī aļģes un augus.

Unikonta (Sarcomastigota) Cavalier-Smith, 1987

labot šo sadaļu

Tips: Amoebozoa Cavalier-Smith, 1998

labot šo sadaļu

Klada: Opisthokonta Cavalier-Smith 1981

labot šo sadaļu
Holozoa
Holomycota

Bikonta (Biciliata) Cavalier-Smith, 2002

labot šo sadaļu

Valsts: Archaeplastida (Primoplantae) Sina Adl, 2005

labot šo sadaļu

Nodalījums: Glaucophyta Heinrich L. Skuja, 1954

Nodalījums: Rhodophyta Wettstein, 1922

Valsts: Chromista Cavalier-Smith, 1981

labot šo sadaļu

Apakšvalsts: SAR Cavalier-Smith, 2010

labot šo sadaļu
Infravalsts: Rhizaria Cavalier-Smith, 2002
labot šo sadaļu
Tips: Cercozoa Cavalier-Smith, 1998
labot šo sadaļu
Tips: Retaria Cavalier-Smith, 2002
labot šo sadaļu
Infravalsts: Heterokontophyta (Heterokonta) Cavalier-Smith, 1986
labot šo sadaļu
Infravalsts: Alveolata Cavalier-Smith, 1991
labot šo sadaļu

Phlyum Ciliophora Doflein, 1901

Tips: Myzozoa T. Cavalier-Smith & E.E. Chao, 2004

Nodalījums: Haptophyta (Prymnesiophyta) Hibberd & Cavalier-Smith, 1986

labot šo sadaļu

Nodalījums: Cryptophyta Pascher, 1914

labot šo sadaļu

Excavata (Cavalier-Smith) Simpson, 2003

labot šo sadaļu

Eozoa Cavalier-Smith, 2003

labot šo sadaļu
Tips: Loukozoa Cavalier-Smith, 1999
labot šo sadaļu

Tips: Percolozoa Cavalier-Smith 1991

labot šo sadaļu

Tips: Euglenozoa (Euglenophyta) Cavalier-Smith, 1981[2]

labot šo sadaļu
  1. «whittaker new concepts of kingdoms – Google Scholar». scholar.google.ca. Skatīts: 2016-02-28.
  2. T. Cavalier-Smith (1981). "Eukaryote kingdoms: seven or nine". BioSystems 14 (3–4): 461–481. doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID 7337818.