- Freimaurerlieder zum Gebrauch der Vereinigten Logen in Russland, St. Petersburg, 1780
- Freimaurerlieder zum Gebrauch der vereinigten Logen in Russland, St. Petersburg, 1787
- Auswahl von Freimaurerliedern. Durch die E. Loge Muse „Urania“ gesammelt von Böber, St. Petersburg, 1788
- Verzeichnis der Pflanzen, die von Ritter J. von Böber in Taurien und Katharinoslavischen Gouvernement gasammelt worden sind, in: G. Ch. Reichs Magazin des Pflanzenreichs, Erlangen, 1793, Bd. I, S. 154-166.
- Schreiben des Herrn Goffrath und Studien-Direktor Böber aus Ekaterinoslaw vom 25.Oktober 1792, in: Neue Nordische Beiträge, 1793, Bd. 6, S. 256-264.